Manipulace s Biostrings
Pomocí krátké sekvence (dna_seq) z objektu zikaVirus si teď sám/sama vyzkoušíš dva biologické procesy: transkripci a translaci.
V prvních dvou částech tohoto cvičení je budeš aplikovat odděleně. V poslední části je pak provedeš najednou v jediném kroku.
V tomto cvičení pracuješ s velmi krátkou sekvencí, ale pamatuj, že skutečná síla Biostrings se projeví při práci s mnohem většími sekvencemi.
Balíček Biostrings je už načtený. Z objektu zikaVirus přeložíš prvních 21 znaků do AAString.
Toto cvičení je součástí kurzu
Úvod do Bioconductoru v R
Interaktivní cvičení na vyzkoušení si v praxi
Vyzkoušejte si toto cvičení dokončením tohoto ukázkového kódu.
# Unlist the set, select the first 21 letters, and assign to dna_seq
dna_seq <- subseq(___(___), end = 21)
dna_seq
# Transcribe dna_seq into an RNAString object and print it
___ <- ___(dna_seq)
rna_seq