Začněte nyníZačněte zdarma

Vytváření objektů IRanges

Ve videu jsme si ukázali několik příkladů konstruktoru IRanges. Teď je řada na tobě – procvič si vytváření sekvenčních rozsahů s různými argumenty a podívej se, jak se tyto argumenty doplňují nebo nahrazují navzájem.

Pomocí funkce IRanges() můžeš zadávat parametry jako start, end nebo width. Tyto parametry spadají do jedné ze dvou kategorií:

  • start, end a width jsou číselné vektory.
  • Parametr start je logický vektor.

Chybějící argumenty se doplní na základě vztahu width = end - start + 1.

Konstruktor IRanges() označuje všechny parametry jako nepovinné s výchozí hodnotou NULL:

IRanges(start = NULL, end = NULL, width = NULL, names = NULL)

Toto cvičení je součástí kurzu

Úvod do Bioconductoru v R

Zobrazit kurz

Pokyny k cvičení

Vytvoř tři objekty IRanges s následujícími argumenty:

  • IRnum1: start roven vektoru hodnot 1 až 5 a end roven 100.
  • IRnum2: end rovno 100 a width rovno hodnotám 89 a 10.
  • IRlog1: start rovno Rle(c(F, T, T, T, F, T, T, T)).
  • Vypiš objekty a prohlédni si výsledky!

Interaktivní cvičení na vyzkoušení si v praxi

Vyzkoušejte si toto cvičení dokončením tohoto ukázkového kódu.

# Load IRanges package
library(___)

# IRnum1: start - vector 1 through 5, end - 100  
IRnum1 <- ___

# IRnum2: end - 100, width - 89 and 10
IRnum2 <- ___

# IRlog1: start = Rle(c(F, T, T, T, F, T, T, T)))
IRlog1 <- IRanges(___ = Rle(___))

# Print objects in a list
print(list(IRnum1 = IRnum1, IRnum2 = IRnum2, IRlog1 = IRlog1))
Upravit a spustit kód