1. Učit se
    2. /
  2. Kurzy
    3. /
  3. Úvod do Bioconductoru v R
Connected

cvičení

Nejčastější funkce pro manipulaci se sekvencemi

Doposud jsi se seznámil/a s nejběžnějšími funkcemi pro manipulaci se sekvencemi: 

reverse()
complement()
reverseComplement()
translate()

V praxi můžeš pomocí těchto funkcí pracovat i s velmi velkými sekvencemi.

Aby ses ale přesvědčil/a, co jednotlivé funkce dělají a jaké vrací výsledky, použiješ v tomto cvičení malou podmnožinu. Objekt zikv, který jsi předtím vyextrahoval/a z genomu viru Zika, obsahuje pouze 30 bází.

Pokyny

100 XP

Otestuj jednotlivé funkce na sekvenci zikv:

  • Obrať sekvenci.
  • Urči komplement sekvence.
  • Urči reverzní komplement sekvence.
  • Přelož sekvenci.