Začněte nyníZačněte zdarma

Odstranění duplikátů

Vždy je dobré zkontrolovat, jestli sekvenční čtení neobsahují příliš mnoho duplikátů.

# Sample with duplicates of class: ShortReadQ
dfqsample

# Get the reads from dfqsample
mydReads <- sread(dfqsample)

# Counting duplicates
table(srduplicated(mydReads))

Jak bys odstranil/a duplikovaná čtení ze souboru? Pozor na to, jaká podmínka má být použita v tomto filtru.

Toto cvičení je součástí kurzu

Úvod do Bioconductoru v R

Zobrazit kurz

Interaktivní praktické cvičení

Proměňte teorii v praxi s jedním z našich interaktivních cvičení

Začít cvičení