Instalace balíčků pomocí BiocManageru
BSgenome je datový balíček z Bioconductoru, který obsahuje reprezentace několika genomů. Balíček je za tebe už nainstalovaný – instalace závislostí totiž obvykle zabere dost času. Použil se k tomu tento kód:
# Instalace BSgenome
BiocManager::install("BSgenome")
Toto cvičení je součástí kurzu
Úvod do Bioconductoru v R
Pokyny k cvičení
- Pomocí
library()načti balíčekBSgenome. Poznámka:BSgenomeje za tebe již nainstalovaný. - Projdi si výstupní zprávy a podívej se, které balíčky jsou vyžadovány.
- Zkontroluj verze všech balíčků načtených v aktuální session.
Interaktivní cvičení na vyzkoušení si v praxi
Vyzkoušejte si toto cvičení dokončením tohoto ukázkového kódu.
# Load the BSgenome package
___
# Check the versions of the packages loaded in the session
___