สำรวจจีโนมของยีสต์
เริ่มสำรวจจีโนมของยีสต์ด้วยตัวเองโดยใช้แพ็กเกจ BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3 ซึ่งติดตั้งให้เรียบร้อยแล้ว
เช่นเดียวกับข้อมูลอื่น ๆ ใน R สามารถใช้ head() และ tail() เพื่อสำรวจออบเจ็กต์ yeastGenome ได้ นอกจากนี้ยังสามารถเลือกดูจีโนมทีละโครโมโซมโดยใช้ไวยากรณ์ $ ในรูปแบบ object_name$chromosome_name
ใช้ฟังก์ชัน names() เพื่อดูชื่อโครโมโซม และใช้ nchar() เพื่อนับจำนวนอักขระในลำดับนิวคลีโอไทด์
แบบฝึกหัดนี้เป็นส่วนหนึ่งของหลักสูตร
Bioconductor เบื้องต้นใน R
แบบฝึกหัดเชิงโต้ตอบแบบลงมือทำ
ลองทำแบบฝึกหัดนี้โดยเติมโค้ดตัวอย่างนี้ให้สมบูรณ์
# Load the yeast genome
___
# Assign data to the yeastGenome object
yeastGenome <- ___