การลบรีดที่ซ้ำกัน
การตรวจสอบว่า sequence reads ไม่มีรีดซ้ำกันมากเกินไปเป็นสิ่งสำคัญที่ควรทำเป็นประจำ
# Sample with duplicates of class: ShortReadQ
dfqsample
# Get the reads from dfqsample
mydReads <- sread(dfqsample)
# Counting duplicates
table(srduplicated(mydReads))
จะลบรีดที่ซ้ำกันออกจากไฟล์ได้อย่างไร ลองพิจารณาเงื่อนไขที่ถูกต้องสำหรับการกรองข้อมูลนี้ดู
แบบฝึกหัดนี้เป็นส่วนหนึ่งของหลักสูตร
Bioconductor เบื้องต้นใน R
แบบฝึกหัดเชิงโต้ตอบแบบลงมือทำจริง
เปลี่ยนทฤษฎีให้เป็นการลงมือทำด้วยแบบฝึกหัดเชิงโต้ตอบหนึ่งในของเรา
เริ่มแบบฝึกหัด