หน้าต่างลำดับ (Sequence Window)
เพื่อแบ่งส่วนของลำดับออกเป็นช่วงชั่วคราว จะใช้แนวคิดของ window ที่มีความกว้างที่กำหนดและสามารถเลื่อนได้เป็นขั้น ๆ ดังที่ได้เห็นในวิดีโอ GRanges มีฟังก์ชัน slidingWindows() พร้อมอาร์กิวเมนต์อย่าง width และ step
slidingWindows(x, width, step = 1L)
ออบเจกต์ GRanges ชื่อ ABCD1 ซึ่งมี gene id เป็น 215 และความยาว 19895 ได้ถูกโหลดไว้ล่วงหน้าสำหรับแบบฝึกหัดนี้แล้ว ใช้ฟังก์ชัน ranges() เพื่อดูโครงสร้างของมัน
ranges(ABCD1)
หากต้องการให้ได้ 2 window พอดีโดยใช้ step = 1L ค่าสูงสุดที่อนุญาตสำหรับความกว้างของแต่ละ window คือเท่าใด
แบบฝึกหัดนี้เป็นส่วนหนึ่งของหลักสูตร
Bioconductor เบื้องต้นใน R
แบบฝึกหัดเชิงโต้ตอบแบบลงมือทำจริง
เปลี่ยนทฤษฎีให้เป็นการลงมือทำด้วยแบบฝึกหัดเชิงโต้ตอบหนึ่งในของเรา
เริ่มแบบฝึกหัด