เริ่มต้นใช้งานเริ่มต้นใช้งานได้ฟรี

หน้าต่างลำดับ (Sequence Window)

เพื่อแบ่งส่วนของลำดับออกเป็นช่วงชั่วคราว จะใช้แนวคิดของ window ที่มีความกว้างที่กำหนดและสามารถเลื่อนได้เป็นขั้น ๆ ดังที่ได้เห็นในวิดีโอ GRanges มีฟังก์ชัน slidingWindows() พร้อมอาร์กิวเมนต์อย่าง width และ step

slidingWindows(x, width, step = 1L)

ออบเจกต์ GRanges ชื่อ ABCD1 ซึ่งมี gene id เป็น 215 และความยาว 19895 ได้ถูกโหลดไว้ล่วงหน้าสำหรับแบบฝึกหัดนี้แล้ว ใช้ฟังก์ชัน ranges() เพื่อดูโครงสร้างของมัน

ranges(ABCD1)

หากต้องการให้ได้ 2 window พอดีโดยใช้ step = 1L ค่าสูงสุดที่อนุญาตสำหรับความกว้างของแต่ละ window คือเท่าใด

แบบฝึกหัดนี้เป็นส่วนหนึ่งของหลักสูตร

Bioconductor เบื้องต้นใน R

ดูคอร์ส

แบบฝึกหัดเชิงโต้ตอบแบบลงมือทำจริง

เปลี่ยนทฤษฎีให้เป็นการลงมือทำด้วยแบบฝึกหัดเชิงโต้ตอบหนึ่งในของเรา

เริ่มแบบฝึกหัด