การจัดการ Biostrings
โดยใช้ลำดับสั้น ๆ (dna_seq) จากออบเจกต์ zikaVirus ถึงคราวของคุณแล้วที่จะลองทำกระบวนการทางชีววิทยาสองอย่าง ได้แก่ การถอดรหัส (transcription) และ การแปลรหัส (translation)
ในสองส่วนแรกของแบบฝึกหัดนี้ คุณจะนำกระบวนการทั้งสองไปใช้แยกกัน และในส่วนสุดท้ายจะนำไปใช้ในขั้นตอนเดียว
ลำดับที่ใช้ในแบบฝึกหัดนี้มีขนาดเล็กมาก แต่จงจำไว้ว่าพลังของ Biostrings จะแสดงออกมาอย่างเต็มที่เมื่อจัดการกับลำดับที่มีขนาดใหญ่กว่านี้มาก
แพ็กเกจ Biostrings ถูกโหลดไว้ให้แล้ว โดยใช้ zikaVirus คุณจะแปลรหัส 21 ตัวอักษรแรกให้เป็น AAString
แบบฝึกหัดนี้เป็นส่วนหนึ่งของหลักสูตร
Bioconductor เบื้องต้นใน R
แบบฝึกหัดเชิงโต้ตอบแบบลงมือทำ
ลองทำแบบฝึกหัดนี้โดยเติมโค้ดตัวอย่างนี้ให้สมบูรณ์
# Unlist the set, select the first 21 letters, and assign to dna_seq
dna_seq <- subseq(___(___), end = 21)
dna_seq
# Transcribe dna_seq into an RNAString object and print it
___ <- ___(dna_seq)
rna_seq