เริ่มต้นใช้งานเริ่มต้นใช้งานได้ฟรี

ฟังก์ชันการจัดการลำดับที่ใช้บ่อย

จนถึงตอนนี้ คุณได้เรียนรู้ฟังก์ชันการจัดการลำดับที่ใช้บ่อยที่สุดแล้ว ได้แก่

reverse()
complement()
reverseComplement()
translate()

ในการใช้งานจริง คุณสามารถจัดการลำดับขนาดใหญ่มากได้ด้วยฟังก์ชันเหล่านี้

อย่างไรก็ตาม เพื่อให้เห็นผลลัพธ์ของฟังก์ชันได้ชัดเจนในแบบฝึกหัดนี้ จะใช้ลำดับย่อยขนาดเล็กแทน โดย zikv ซึ่งได้ตัดแบ่งมาจากจีโนมของไวรัสซิกามีเพียง 30 เบสเท่านั้น

แบบฝึกหัดนี้เป็นส่วนหนึ่งของหลักสูตร

Bioconductor เบื้องต้นใน R

ดูคอร์ส

คำแนะนำการฝึกหัด

ทดสอบฟังก์ชันโดยใช้ zikv:

  • กลับลำดับของลำดับ
  • หาคอมพลีเมนต์ของลำดับ
  • หาคอมพลีเมนต์แบบกลับด้านของลำดับ
  • แปลลำดับเป็นโปรตีน

แบบฝึกหัดเชิงโต้ตอบแบบลงมือทำ

ลองทำแบบฝึกหัดนี้โดยเติมโค้ดตัวอย่างนี้ให้สมบูรณ์

# Reverse the zikv sequence
reverse(___)

# Complement the zikv sequence
___

# Reverse complement the zikv sequence
___

# Translate the zikv sequence
___
แก้ไขและรันโค้ด