เริ่มต้นใช้งานเริ่มต้นใช้งานได้ฟรี

ค้นหารูปแบบในลำดับ

ลองค้นหารูปแบบที่ปรากฏในชุด zikaVirus โดยใช้ vmatchPattern() จากนั้นลองค้นหารูปแบบเดียวกันด้วย matchPattern() กับลำดับเดี่ยว zikv

# For Sets
vmatchPattern(pattern = "ACATGGGCCTACCATGGGAG", 
              subject = zikaVirus, max.mismatch = 1)

# For single sequences
matchPattern(pattern = "ACATGGGCCTACCATGGGAG", 
              subject = zikv, max.mismatch = 1)

ทั้งสองฟังก์ชันควรพบจำนวนครั้งที่ตรงกันเท่ากัน แต่จะสังเกตได้ว่าผลลัพธ์มีรูปแบบแตกต่างกัน เมื่อรันการค้นหารูปแบบแต่ละแบบแยกกัน จะได้ผลลัพธ์ที่ตรงกันกี่รายการ?

แบบฝึกหัดนี้เป็นส่วนหนึ่งของหลักสูตร

Bioconductor เบื้องต้นใน R

ดูคอร์ส

แบบฝึกหัดเชิงโต้ตอบแบบลงมือทำจริง

เปลี่ยนทฤษฎีให้เป็นการลงมือทำด้วยแบบฝึกหัดเชิงโต้ตอบหนึ่งในของเรา

เริ่มแบบฝึกหัด