ทำไมต้องใช้ fastq?
จนถึงตอนนี้ ได้รู้จักแพ็กเกจ ShortRead ที่มีเครื่องมือสำหรับขั้นตอนเริ่มต้นของการวิเคราะห์ลำดับ short-read ไปแล้ว สรุปฟังก์ชันหลักของแพ็กเกจนี้ได้ดังนี้:
- การนำเข้าข้อมูล
- การประเมินคุณภาพ
- การแปลงข้อมูล
- การเข้าถึงขั้นตอนการวิเคราะห์ถัดไป
ในบริบทนี้ ได้ทำความรู้จักกับไฟล์สองประเภท ได้แก่ fasta และ fastq
คิดว่าเหตุผลที่ต้องใช้ไฟล์รูปแบบ fastq คืออะไร?
แบบฝึกหัดนี้เป็นส่วนหนึ่งของหลักสูตร
Bioconductor เบื้องต้นใน R
แบบฝึกหัดเชิงโต้ตอบแบบลงมือทำจริง
เปลี่ยนทฤษฎีให้เป็นการลงมือทำด้วยแบบฝึกหัดเชิงโต้ตอบหนึ่งในของเรา
เริ่มแบบฝึกหัด