Kom igångKom igång gratis

Utforska jästgenomet

Nu ska du börja utforska jästgenomet på egen hand med hjälp av paketet BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3, som redan är installerat.

Precis som med andra data i R kan du använda head() och tail() för att utforska objektet yeastGenome. Du kan också välja ut ett specifikt kromosom ur genomet med $-syntax enligt följande: object_name$chromosome_name.

Kromosomernas namn hämtar du med funktionen names(), och nchar() används för att räkna antalet tecken i en sekvens.

Den här övningen är en del av kursen

Introduktion till Bioconductor i R

Visa kurs

Interaktiv övning med praktiskt arbete

Testa den här övningen genom att slutföra den här exempelkoden.

# Load the yeast genome
___

# Assign data to the yeastGenome object
yeastGenome <- ___
Redigera och kör kod