Ett sekvenfönster
För att tillfälligt dela upp delar av dina sekvenser använder du konceptet fönster med en given bredd som kan förflyttas i steg. Som du sett i videon tillhandahåller GRanges funktionen slidingWindows(), med argument som width och step.
slidingWindows(x, width, step = 1L)
GRanges-objektet ABCD1, med gen-id 215 och längden 19895, har förinslästs för den här övningen. Använd funktionen ranges() för att se dess struktur.
ranges(ABCD1)
Om du behöver exakt 2 fönster med step = 1L, vad är då det maximala antalet som är tillåtet för bredden på varje fönster?
Den här övningen är en del av kursen
Introduktion till Bioconductor i R
Interaktiv övning med praktiskt arbete
Gör teori till handling med en av våra interaktiva övningar
Starta övningen