Kom igångKom igång gratis

Ett sekvenfönster

För att tillfälligt dela upp delar av dina sekvenser använder du konceptet fönster med en given bredd som kan förflyttas i steg. Som du sett i videon tillhandahåller GRanges funktionen slidingWindows(), med argument som width och step.

slidingWindows(x, width, step = 1L)

GRanges-objektet ABCD1, med gen-id 215 och längden 19895, har förinslästs för den här övningen. Använd funktionen ranges() för att se dess struktur.

ranges(ABCD1)

Om du behöver exakt 2 fönster med step = 1L, vad är då det maximala antalet som är tillåtet för bredden på varje fönster?

Den här övningen är en del av kursen

Introduktion till Bioconductor i R

Visa kurs

Interaktiv övning med praktiskt arbete

Gör teori till handling med en av våra interaktiva övningar

Starta övningen