Arbeta med IRanges
Du kan använda funktionen IRanges() för att skapa en enskild sekvens. Det går också att skicka in vektorer till IRanges() för att skapa flera sekvensintervall på en gång. Det är både praktiskt och användbart! Skapandet av objekten seq_1 och seq_2 är exempel på detta.
I den här övningen ska du kontrollera bredden på var och en av de angivna sekvenserna med hjälp av width() och lengths(). Lägg märke till skillnaden mellan de två typerna av utdata.
Kom ihåg att width = end - start + 1.
Den här övningen är en del av kursen
Introduktion till Bioconductor i R
Interaktiv övning med praktiskt arbete
Testa den här övningen genom att slutföra den här exempelkoden.
# Create the first sequence seq_1
seq_1 <- IRanges(start = 10, end = 37)
# Create the second sequence seq_2
seq_2 <- IRanges(start = c(5, 35, 50),
end = c(12, 39, 61),
names = LETTERS[1:3])
# Check the width of seq_1 and seq_2
___
___