Manipulera Biostrings
Med hjälp av en kort sekvens (dna_seq) från objektet zikaVirus är det dags att prova de två biologiska processerna transkription och translation.
I de två första delarna av övningen tillämpar du dessa processer var för sig. I den sista delen utför du dem i ett enda steg.
Du arbetar med en mycket liten sekvens här, men kom ihåg att styrkan med Biostrings verkligen visar sig när du manipulerar mycket större sekvenser.
Paketet Biostrings har redan laddats åt dig. Med hjälp av zikaVirus ska du översätta de första 21 tecknen till en AAString.
Den här övningen är en del av kursen
Introduktion till Bioconductor i R
Interaktiv övning med praktiskt arbete
Testa den här övningen genom att slutföra den här exempelkoden.
# Unlist the set, select the first 21 letters, and assign to dna_seq
dna_seq <- subseq(___(___), end = 21)
dna_seq
# Transcribe dna_seq into an RNAString object and print it
___ <- ___(dna_seq)
rna_seq