Kom igångKom igång gratis

Ta bort dubbletter

Det är alltid god praxis att kontrollera att dina sekvensreads inte innehåller för många dubbletter.

# Sample med dubbletter av klassen: ShortReadQ
dfqsample

# Hämta reads från dfqsample
mydReads <- sread(dfqsample)

# Räkna dubbletter
table(srduplicated(mydReads))

Hur skulle du gå till väga för att ta bort duplicerade reads i en fil? Tänk på vilket villkor som bör användas i filtret.

Den här övningen är en del av kursen

Introduktion till Bioconductor i R

Visa kurs

Interaktiv övning med praktiskt arbete

Gör teori till handling med en av våra interaktiva övningar

Starta övningen