Odkrywanie genomu drożdży
Zaczniesz samodzielnie eksplorować genom drożdży, korzystając z pakietu BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3, który jest już zainstalowany.
Podobnie jak w przypadku innych danych w R, możesz użyć funkcji head() i tail(), aby przejrzeć obiekt yeastGenome. Możesz też wybrać konkretny chromosom, korzystając ze składni $: object_name$chromosome_name.
Nazwy chromosomów uzyskasz za pomocą funkcji names(), a nchar() pozwoli ci policzyć liczbę znaków w sekwencji.
To ćwiczenie jest częścią kursu
Wprowadzenie do Bioconductor w R
Interaktywne ćwiczenie praktyczne
Spróbuj tego ćwiczenia, uzupełniając ten przykładowy kod.
# Load the yeast genome
___
# Assign data to the yeastGenome object
yeastGenome <- ___