1. Nauka
  2. /
  3. Kursy
  4. /
  5. Wprowadzenie do Bioconductor w R

Connected

ćwiczenie

Odkrywanie genomu drożdży

Zaczniesz samodzielnie eksplorować genom drożdży, korzystając z pakietu BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3, który jest już zainstalowany.

Podobnie jak w przypadku innych danych w R, możesz użyć funkcji head() i tail(), aby przejrzeć obiekt yeastGenome. Możesz też wybrać konkretny chromosom, korzystając ze składni $: object_name$chromosome_name.

Nazwy chromosomów uzyskasz za pomocą funkcji names(), a nchar() pozwoli ci policzyć liczbę znaków w sekwencji.

Instrukcje 1/3

undefined XP
    1
    2
    3
  • Wczytaj pakiet genomu drożdży BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3 i przypisz go do zmiennej yeastGenome.