Eksploracja sekwencji wirusa Zika

Czas na samodzielną eksplorację genomu wirusa Zika, który został wczytany do twojego środowiska jako zikaVirus. Genom pobrano z NCBI i możesz użyć funkcji z pakietu Biostrings, aby dowiedzieć się o nim więcej.

Rozpocznij od sprawdzenia alfabetu sekwencji.

alphabet() # Pokazuje litery zawarte w sekwencji
alphabetFrequency() # Pokazuje liczbę wystąpień każdej litery

Pamiętaj z filmu, że każdy alfabet odpowiada konkretnemu kontenerowi Biostrings, a każdy alfabet zazwyczaj zawiera dodatkowe litery kodujące i symbole.

Użyj alphabet(), aby sprawdzić, jakie litery zawiera zikaVirus.

ćwiczenie

Eksploracja sekwencji wirusa Zika

Instrukcje 1/3

.css-6su6fj{-webkit-flex-shrink:0;-ms-flex-negative:0;flex-shrink:0;}ćwiczenie

Instrukcje 1/3

ćwiczenie