1. Nauka
  2. /
  3. Kursy
  4. /
  5. Wprowadzenie do Bioconductor w R

Connected

ćwiczenie

Wyszukiwanie wzorca

Znajdźmy wystąpienia wzorca w zbiorze zikaVirus za pomocą vmatchPattern(). Następnie wykonajmy to samo wyszukiwanie za pomocą matchPattern() dla pojedynczej sekwencji, zikv.

# For Sets
vmatchPattern(pattern = "ACATGGGCCTACCATGGGAG", 
              subject = zikaVirus, max.mismatch = 1)
# For single sequences
matchPattern(pattern = "ACATGGGCCTACCATGGGAG", 
              subject = zikv, max.mismatch = 1)

Obie funkcje powinny znaleźć tę samą liczbę wystąpień, ale wyniki będą miały inną postać. Ile dopasowań pojawia się po uruchomieniu każdego wyszukiwania wzorca osobno?

Instrukcje

50 XP

Możliwe odpowiedzi