Okno sekwencji

Aby tymczasowo podzielić fragmenty sekwencji na części, skorzystasz z koncepcji okien o określonej szerokości, które mogą przesuwać się krokami. Jak widzieliśmy w filmie, GRanges udostępnia funkcję slidingWindows() z argumentami takimi jak width i step.

slidingWindows(x, width, step = 1L)

Obiekt GRanges o nazwie ABCD1, z identyfikatorem genu 215 i długością 19895, został wstępnie wczytany na potrzeby tego ćwiczenia. Użyj funkcji ranges(), aby zobaczyć jego strukturę.

ranges(ABCD1)

Jeśli potrzebujesz dokładnie 2 okien przy użyciu step = 1L, jaka jest maksymalna dozwolona szerokość każdego okna?

Możliwe odpowiedzi

Długość genomu

Długość obiektu GRanges minus 1

Długość obiektu GRanges

Dowolna mniejsza długość

ćwiczenie

Okno sekwencji

Instrukcje

Możliwe odpowiedzi

.css-6su6fj{-webkit-flex-shrink:0;-ms-flex-negative:0;flex-shrink:0;}ćwiczenie

Instrukcje

Możliwe odpowiedzi

ćwiczenie