Manipulowanie obiektami Biostrings
Korzystając z krótkiej sekwencji (dna_seq) pobranej z obiektu zikaVirus, przećwiczysz dwa biologiczne procesy: transkrypcję i translację.
W pierwszych dwóch częściach tego ćwiczenia zastosujesz te procesy osobno. W ostatniej części wykonasz je w jednym kroku.
W tym ćwiczeniu pracujesz na bardzo krótkiej sekwencji, ale pamiętaj – prawdziwa moc pakietu Biostrings ujawnia się przy pracy z sekwencjami znacznie większych rozmiarów.
Pakiet Biostrings jest już załadowany. Korzystając z obiektu zikaVirus, przetłumacz pierwsze 21 znaków na obiekt AAString.
To ćwiczenie jest częścią kursu
Wprowadzenie do Bioconductor w R
Interaktywne ćwiczenie praktyczne
Spróbuj tego ćwiczenia, uzupełniając ten przykładowy kod.
# Unlist the set, select the first 21 letters, and assign to dna_seq
dna_seq <- subseq(___(___), end = 21)
dna_seq
# Transcribe dna_seq into an RNAString object and print it
___ <- ___(dna_seq)
rna_seq