1. Nauka
    2. /
  2. Kursy
    3. /
  3. Wprowadzenie do Bioconductor w R
Connected

ćwiczenie

Najczęściej używane funkcje manipulacji sekwencjami

Do tej pory poznałeś(-aś) najpopularniejsze funkcje do manipulacji sekwencjami:

reverse()
complement()
reverseComplement()
translate()

W praktyce możesz za ich pomocą przetwarzać naprawdę duże sekwencje.

Aby jednak zobaczyć działanie tych funkcji w tym ćwiczeniu, skorzystasz z niewielkiego fragmentu. Obiekt zikv, który wcześniej wyodrębniono z genomu wirusa Zika, zawiera tylko 30 zasad.

Instrukcje

100 XP

Przetestuj funkcje, używając zikv:

  • Odwróć sekwencję.
  • Wyznacz komplement sekwencji.
  • Wyznacz odwrotny komplement sekwencji.
  • Przetłumacz sekwencję.