Zacznij terazZacznij za darmo

Tworzenie obiektów IRanges

W lekcji wideo pokazano przykłady użycia konstruktora IRanges. Teraz twoja kolej – poćwicz tworzenie zakresów sekwencji z różnymi argumentami i sprawdź, jak są one uzupełniane lub ponownie wykorzystywane.

Funkcja IRanges() pozwala określać parametry takie jak start, end czy width. Dane wejściowe tych parametrów mogą należeć do jednej z dwóch kategorii:

  • start, end i width są wektorami numerycznymi.
  • Parametr start jest wektorem logicznym.

Brakujące argumenty są wyznaczane na podstawie równania width = end - start + 1.

Konstruktor IRanges() wskazuje, że wszystkie parametry są opcjonalne i domyślnie mają wartość NULL:

IRanges(start = NULL, end = NULL, width = NULL, names = NULL)

To ćwiczenie jest częścią kursu

Wprowadzenie do Bioconductor w R

Zobacz kurs

Instrukcje do ćwiczenia

Utwórz trzy obiekty IRanges z następującymi argumentami:

  • IRnum1: start równy wektorowi wartości od 1 do 5 oraz end równy 100.
  • IRnum2: end równy 100 i width równy 89 oraz 10.
  • IRlog1: start równy Rle(c(F, T, T, T, F, T, T, T)).
  • Wyświetl obiekty i sprawdź wyniki!

Interaktywne ćwiczenie praktyczne

Spróbuj tego ćwiczenia, uzupełniając ten przykładowy kod.

# Load IRanges package
library(___)

# IRnum1: start - vector 1 through 5, end - 100  
IRnum1 <- ___

# IRnum2: end - 100, width - 89 and 10
IRnum2 <- ___

# IRlog1: start = Rle(c(F, T, T, T, F, T, T, T)))
IRlog1 <- IRanges(___ = Rle(___))

# Print objects in a list
print(list(IRnum1 = IRnum1, IRnum2 = IRnum2, IRlog1 = IRlog1))
Edytuj i uruchom kod