1. Nauka
  2. /
  3. Kursy
  4. /
  5. Wprowadzenie do Bioconductor w R

Connected

ćwiczenie

Szukanie dopasowania

Z poprzedniego ćwiczenia masz dwa obiekty: selectedSet (zbiór) i selectedSeq (pojedyncza sekwencja).

Odkryłeś niedawno, że wzorzec ns5 znajduje się w ramce 3 sekwencji AAzika6F. Teraz sprawdzisz, jak wygląda dopasowanie, używając selectedSet i selectedSeq.

Instrukcje 1/2

undefined XP
  • 1
    • Użyj vmatchPattern() na odpowiednim zbiorze i ustaw max.mismatch = 15.
  • 2
    • Użyj matchPattern() na odpowiedniej pojedynczej sekwencji i ustaw max.mismatch = 15.