出芽酵母ゲノムを探ってみましょう
あらかじめインストールされている BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3 パッケージを使って、酵母ゲノムを実際に探索していきます。
R のほかのデータと同様に、yeastGenome オブジェクトは head() と tail() で確認できます。ゲノムを染色体ごとに取り出すには、次のように $ 構文を使います:object_name$chromosome_name。
染色体名は names() で取得でき、配列中の文字数は nchar() で数えられます。
この演習はコースの一部です
Rで始めるBioconductor入門
実践的なインタラクティブ演習
このサンプルコードを完成させて、この演習に挑戦してみましょう。
# Load the yeast genome
___
# Assign data to the yeastGenome object
yeastGenome <- ___