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演習

出芽酵母ゲノムを探ってみましょう

あらかじめインストールされている BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3 パッケージを使って、酵母ゲノムを実際に探索していきます。

R のほかのデータと同様に、yeastGenome オブジェクトは head() と tail() で確認できます。ゲノムを染色体ごとに取り出すには、次のように $ 構文を使います：object_name$chromosome_name。

染色体名は names() で取得でき、配列中の文字数は nchar() で数えられます。

指示1 / 3

undefined XP
    1
    2
    3
  • BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3 酵母ゲノムパッケージを読み込み、yeastGenome に代入します。