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出芽酵母ゲノムを探ってみましょう

あらかじめインストールされている BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3 パッケージを使って、酵母ゲノムを実際に探索していきます。

R のほかのデータと同様に、yeastGenome オブジェクトは head()tail() で確認できます。ゲノムを染色体ごとに取り出すには、次のように $ 構文を使います:object_name$chromosome_name

染色体名は names() で取得でき、配列中の文字数は nchar() で数えられます。

この演習はコースの一部です

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実践的なインタラクティブ演習

このサンプルコードを完成させて、この演習に挑戦してみましょう。

# Load the yeast genome
___

# Assign data to the yeastGenome object
yeastGenome <- ___
コードを編集して実行