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Biostrings の操作

zikaVirus オブジェクトに含まれる短い配列(dna_seq)を使って、転写翻訳 という2つの生物学的プロセスに取り組みます。

この演習の最初の2つのパートでは、それぞれのプロセスを個別に行います。最後のパートでは、1ステップでまとめて行います。

ここではとても短い配列を使いますが、Biostrings の真価は、はるかに大きな配列を操作するときに発揮されることを覚えておいてください。

Biostrings パッケージはすでに読み込まれています。zikaVirus を使って、最初の21文字を AAString に翻訳します。

この演習はコースの一部です

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実践的なインタラクティブ演習

このサンプルコードを完成させて、この演習に挑戦してみましょう。

# Unlist the set, select the first 21 letters, and assign to dna_seq
dna_seq <- subseq(___(___), end = 21)
dna_seq

# Transcribe dna_seq into an RNAString object and print it
___ <- ___(dna_seq) 
rna_seq
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