ジカウイルス配列を探検しよう

ワークスペースにはジカウイルスのゲノムが zikaVirus として読み込まれています。ゲノムは NCBI から取得したもので、Biostrings の関数を使って内容を確認できます。

まずは配列のアルファベットを確認しましょう。

alphabet() # 配列に含まれる文字（塩基記号）を表示します
alphabetFrequency() # 文字ごとの出現回数を表示します

動画で見たとおり、各アルファベットは特定の Biostrings コンテナに対応しており、通常は追加のコード文字や記号も含まれます。