シーケンスのウィンドウ

配列の一部を一時的に区切るには、一定の幅を持ち、ステップで移動できるウィンドウという考え方を使います。動画で見たとおり、GRanges には width や step といった引数をとる slidingWindows() 関数があります。

slidingWindows(x, width, step = 1L)

この演習では、遺伝子ID 215、長さ 19895 の GRanges オブジェクト ABCD1 があらかじめ読み込まれています。構造を確認するには ranges() 関数を使います。

ranges(ABCD1)

step = 1L を用いてウィンドウをちょうど2つにしたい場合、各ウィンドウの幅として許される最大値はいくつになりますか？

ゲノムの長さ

GRanges オブジェクトの長さ - 1

GRanges オブジェクトの長さ

それより小さい任意の長さ

.css-6su6fj{-webkit-flex-shrink:0;-ms-flex-negative:0;flex-shrink:0;}演習