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重複の除去

配列リードに重複が多すぎないか確認するのは、常に良い習慣です。

# ShortReadQ クラスの重複を含むサンプル
dfqsample

# dfqsample からリードを取得
mydReads <- sread(dfqsample)

# 重複のカウント
table(srduplicated(mydReads))

ファイル内の重複したリードをどのように除去しますか?このフィルターで使う条件に注意してください。

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