ポアソン回帰モデルのプロット
ベイズポアソン回帰モデルの尤度構造を確認しましょう。このモデルでは、ボリューム \(Y\)i を平日ステータス \(X\)i と気温 \(Z\)i で回帰しています:\(Y\)i \(\sim Pois(l\)i) ここで
- \(log(l\)i\() \; = a + b \; X\)i \(+ c \; Z\)i、したがって
- \(l\)i\( \; = exp(a + b \; X\)i \(+ c \; Z\)i\()\)
10,000 イテーションで実行した RJAGS シミュレーションの結果 poisson_sim と、マルコフ連鎖の出力データフレームがワークスペースに用意されています:
> head(poisson_chains, 2)
a b.1. b.2. c
1 5.019807 0 -0.1222143 0.01405269
2 5.018642 0 -0.1217608 0.01407691
これらの結果を使って、事後ポアソン回帰のトレンドをプロットします。この非線形トレンドは、stat_function() を使って ggplot() に追加できます。たとえば、fun = function(x){x^2} と指定すると、二次関数のトレンド曲線が描画されます。
この演習はコースの一部です
RJAGS によるベイズモデリング
演習の手順
次の条件を満たす volume と hightemp の散布図を作成してください:
colorを使って平日と週末を区別します。- 週末における
volumeとhightempの線形関係についての事後平均ポアソン回帰トレンド \(l\)i(l = exp(a + c Z))を表すredの曲線を重ねて表示します。 - 平日における
volumeとhightempの線形関係についての事後平均ポアソン回帰トレンド \(l\)i(l = exp((a + b.2.) + c Z))を表すturquoise3の曲線を重ねて表示します。
実践的なインタラクティブ演習
このサンプルコードを完成させて、この演習に挑戦してみましょう。
# Plot the posterior mean regression models
ggplot(___, aes(x = ___, y = ___, color = ___)) +
geom_point() +
stat_function(fun = function(x){___(mean(___) + mean(___) * x)}, color = "red") +
stat_function(fun = function(x){___(mean(___) + mean(___) + mean(___) * x)}, color = "turquoise3")