Das Hefegenom entdecken
du beginnst, das Hefegenom selbst zu erkunden, und zwar mit dem Paket BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3, das bereits für dich installiert ist.
Wie bei anderen Daten in R kannst du head() und tail() verwenden, um das Objekt yeastGenome zu untersuchen. Du kannst das Genom außerdem per Chromosom mit der $-Syntax wie folgt unterteilen: object_name$chromosome_name.
Die Namen der Chromosomen erhältst du mit der Funktion names(), und mit nchar() kannst du die Anzahl der Zeichen in einer Sequenz zählen.
Diese Übung ist Teil des Kurses
Einführung in Bioconductor in R
Interaktive Übung
Vervollständige den Beispielcode, um diese Übung erfolgreich abzuschließen.
# Load the yeast genome
___
# Assign data to the yeastGenome object
yeastGenome <- ___