Das Hefegenom entdecken
du beginnst, das Hefegenom selbst zu erkunden, und zwar mit dem Paket BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3, das bereits für dich installiert ist.
Wie bei anderen Daten in R kannst du head() und tail() verwenden, um das Objekt yeastGenome zu untersuchen. Du kannst das Genom außerdem per Chromosom mit der $-Syntax wie folgt unterteilen: object_name$chromosome_name.
Die Namen der Chromosomen erhältst du mit der Funktion names(), und mit nchar() kannst du die Anzahl der Zeichen in einer Sequenz zählen.
Diese Übung ist Teil des Kurses
<Kurs>Einführung in Bioconductor in R</Kurs>Interaktive praktische Übung
Versuche dich an dieser Übung, indem du diesen Beispielcode vervollständigst.
# Load the yeast genome
___
# Assign data to the yeastGenome object
yeastGenome <- ___