Warum fastq?
Bisher hast du das Paket ShortRead mit nützlichen Tools für die ersten Schritte der Short-Read-Sequenzanalyse kennengelernt. Zusammengefasst sind die Hauptfunktionen dieses Pakets:
- Dateneingabe
- Qualitätsbewertung
- Datentransformation
- Zugriff auf Downstream-Analysen
In diesem Zusammenhang bist du zwei verschiedenen Dateitypen begegnet: fasta und fastq.
Was ist deiner Meinung nach der Grund, fastq-formatierte Dateien zu verwenden?
Diese Übung ist Teil des Kurses
Einführung in Bioconductor in R
Interaktive Übung
In dieser interaktiven Übung kannst du die Theorie in die Praxis umsetzen.
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