Die Zika-Virus-Sequenz erkunden
Jetzt bist du dran, das Genom des Zika-Virus zu erkunden. Es wurde in deinem Workspace als zikaVirus geladen. Das Genom stammt von NCBI und du kannst Biostrings-Funktionen nutzen, um mehr darüber zu erfahren.
Beginne damit, das Alphabet der Sequenz zu prüfen.
alphabet() # Zeigt die in der Sequenz enthaltenen Buchstaben
alphabetFrequency() # Zeigt die Häufigkeit pro Buchstabe
Denk daran: Jedes Alphabet entspricht einem bestimmten Biostrings-Container, und jedes Alphabet hat normalerweise zusätzliche Code-Buchstaben und Symbole.
Diese Übung ist Teil des Kurses
Einführung in Bioconductor in R
Interaktive Übung
Vervollständige den Beispielcode, um diese Übung erfolgreich abzuschließen.
# Load packages
library(Biostrings)
# Check the alphabet of the zikaVirus
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