Nach einem Muster suchen
Finde einige Vorkommen eines Musters im Set zikaVirus mit vmatchPattern(). Versuche danach die gleiche Mustersuche mit matchPattern() für eine einzelne Sequenz, zikv.
# Für Sets
vmatchPattern(pattern = "ACATGGGCCTACCATGGGAG",
subject = zikaVirus, max.mismatch = 1)
# Für einzelne Sequenzen
matchPattern(pattern = "ACATGGGCCTACCATGGGAG",
subject = zikv, max.mismatch = 1)
Beide Funktionen sollten die gleiche Anzahl an Vorkommen finden, aber die Ausgaben unterscheiden sich. Wie viele Treffer erhalten wir, wenn wir jede Mustersuche einzeln ausführen?
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<Kurs>Einführung in Bioconductor in R</Kurs>Interaktive praktische Übung
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