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Nach einem Muster suchen

Finde einige Vorkommen eines Musters im Set zikaVirus mit vmatchPattern(). Versuche danach die gleiche Mustersuche mit matchPattern() für eine einzelne Sequenz, zikv.

# Für Sets
vmatchPattern(pattern = "ACATGGGCCTACCATGGGAG", 
              subject = zikaVirus, max.mismatch = 1)

# Für einzelne Sequenzen
matchPattern(pattern = "ACATGGGCCTACCATGGGAG", 
              subject = zikv, max.mismatch = 1)

Beide Funktionen sollten die gleiche Anzahl an Vorkommen finden, aber die Ausgaben unterscheiden sich. Wie viele Treffer erhalten wir, wenn wir jede Mustersuche einzeln ausführen?

Diese Übung ist Teil des Kurses

Einführung in Bioconductor in R

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