Biostrings manipulieren
Mit einer kurzen Sequenz (dna_seq) aus dem Objekt zikaVirus bist du jetzt an der Reihe, die beiden biologischen Prozesse Transkription und Translation auszuprobieren.
In den ersten beiden Teilen dieser Übung wendest du diese Prozesse getrennt an. Im letzten Teil führst du sie in einem Schritt aus.
In dieser Übung arbeitest du mit einer sehr kleinen Sequenz, aber denk daran: Die Stärke von Biostrings zeigt sich besonders bei der Verarbeitung deutlich größerer Sequenzen.
Das Paket Biostrings wurde bereits für dich geladen. Mit zikaVirus übersetzt du die ersten 21 Zeichen in ein AAString.
Diese Übung ist Teil des Kurses
<Kurs>Einführung in Bioconductor in R</Kurs>Interaktive praktische Übung
Versuche dich an dieser Übung, indem du diesen Beispielcode vervollständigst.
# Unlist the set, select the first 21 letters, and assign to dna_seq
dna_seq <- subseq(___(___), end = 21)
dna_seq
# Transcribe dna_seq into an RNAString object and print it
___ <- ___(dna_seq)
rna_seq