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Ein Sequenzfenster

Um Abschnitte deiner Sequenzen vorübergehend zu unterteilen, verwendest du das Konzept von Fenstern mit vorgegebenen Breiten, die sich schrittweise bewegen können. Wie du im Video gesehen hast, bietet GRanges die Funktion slidingWindows() mit Argumenten wie width und step.

slidingWindows(x, width, step = 1L)

Das GRanges-Objekt namens ABCD1 mit der Gen-ID 215 und der Länge 19895 wurde für diese Übung vorab geladen. Verwende die Funktion ranges(), um seine Struktur zu sehen.

ranges(ABCD1)

Wenn du genau 2 Fenster mit step = 1L benötigst, wie groß darf die maximale Breite jedes Fensters sein?

Diese Übung ist Teil des Kurses

Einführung in Bioconductor in R

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Interaktive Übung

In dieser interaktiven Übung kannst du die Theorie in die Praxis umsetzen.

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