Duplikate entfernen

Es ist immer eine gute Praxis zu prüfen, dass deine Sequenz-Reads nicht zu viele Duplikate enthalten.

# Sample with duplicates of class: ShortReadQ
dfqsample

# Get the reads from dfqsample
mydReads <- sread(dfqsample)

# Counting duplicates
table(srduplicated(mydReads))

Wie würdest du doppelte Reads in einer Datei entfernen? Achte darauf, welche Bedingung dieser Filter haben sollte.