Meninjau kembali PCA dan Heatmap

Sekarang setelah Anda mengidentifikasi perbedaan utama antar sampel, Anda dapat membuat satu set plot lain untuk membandingkan sampel. Plot ini sangat mirip dengan yang Anda lihat sebelumnya, tetapi kali ini Anda hanya menggunakan puncak yang terikat secara diferensial. Ini mengurangi jumlah derau pada plot dan membantu menekankan perbedaannya. Fungsi pemetaan pada DiffBind memiliki argumen contrast yang memungkinkan Anda menentukan perbandingan mana yang harus digunakan untuk memilih puncak yang akan diplot. Pada latihan ini, Anda akan membandingkan plot asli dengan padanan yang telah dibersihkan.