À la découverte du génome de la levure
Vous allez commencer à explorer vous-même le génome de la levure à l’aide du package BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3, déjà installé pour vous.
Comme pour d’autres objets de données dans R, vous pouvez utiliser head() et tail() pour explorer l’objet yeastGenome. Vous pouvez aussi extraire un chromosome du génome en utilisant la syntaxe $ comme suit : object_name$chromosome_name.
Les noms des chromosomes peuvent être obtenus avec la fonction names(), et nchar() permet de compter le nombre de caractères d’une séquence.
Cet exercice fait partie du cours
Introduction à Bioconductor avec R
Exercice interactif pratique
Essayez cet exercice en complétant cet exemple de code.
# Load the yeast genome
___
# Assign data to the yeastGenome object
yeastGenome <- ___