Explorer la séquence du virus Zika
À vous d’explorer le génome du virus Zika, déjà chargé dans votre espace de travail sous le nom zikaVirus. Le génome a été téléchargé depuis le NCBI et vous pouvez utiliser les fonctions de Biostrings pour en apprendre davantage.
Commencez par vérifier l’alphabet de la séquence.
alphabet() # Affiche les lettres présentes dans la séquence
alphabetFrequency() # Affiche les occurrences par lettre
Rappelez-vous de la vidéo : chaque alphabet correspond à un conteneur biostring spécifique et possède généralement des lettres et des symboles supplémentaires.
Cet exercice fait partie du cours
<cours>Introduction à Bioconductor avec R</cours>Exercice interactif pratique
Essayez cet exercice en complétant ce code d’exemple.
# Load packages
library(Biostrings)
# Check the alphabet of the zikaVirus
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