Interagir avec IRanges
Vous pouvez utiliser la fonction IRanges() pour créer une seule séquence. Vous pouvez aussi passer des vecteurs à IRanges() pour créer plusieurs intervalles de séquence en une seule fois. C’est à la fois fascinant et très pratique ! La création des objets seq_1 et seq_2 en est un bon exemple.
Pour cet exercice, vérifiez la largeur de chacune des séquences fournies ici, en utilisant width() et lengths(). Observez la différence entre les deux types de résultats.
Rappelez-vous que width = end - start + 1.
Cet exercice fait partie du cours
Introduction à Bioconductor avec R
Exercice interactif pratique
Essayez cet exercice en complétant cet exemple de code.
# Create the first sequence seq_1
seq_1 <- IRanges(start = 10, end = 37)
# Create the second sequence seq_2
seq_2 <- IRanges(start = c(5, 35, 50),
end = c(12, 39, 61),
names = LETTERS[1:3])
# Check the width of seq_1 and seq_2
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