Une fenêtre de séquence

Pour découper temporairement vos séquences, vous allez utiliser le concept de fenêtres de largeur donnée, pouvant se déplacer par pas. Comme vous l’avez vu dans la vidéo, GRanges propose la fonction slidingWindows() avec des arguments comme width et step.

slidingWindows(x, width, step = 1L)

L’objet GRanges nommé ABCD1, avec l’identifiant de gène 215 et une longueur de 19895, a été préchargé pour cet exercice. Utilisez la fonction ranges() pour examiner sa structure.

ranges(ABCD1)

Si vous avez besoin exactement de 2 fenêtres avec step = 1L, quelle sera la largeur maximale autorisée pour chacune de ces fenêtres ?