BiocManager pour installer des packages
BSgenome est un package de données Bioconductor qui contient des représentations de plusieurs génomes. Ce package a déjà été installé pour vous, car l’installation des dépendances prend généralement du temps, à l’aide du code suivant :
# Install BSgenome
BiocManager::install("BSgenome")
Cet exercice fait partie du cours
Introduction à Bioconductor avec R
Instructions
- Utilisez
library()pour charger le packageBSgenome. Notez queBSgenomea déjà été installé pour vous. - Lisez les messages affichés et consultez les packages requis.
- Vérifiez les versions de tous les packages chargés dans la session.
Exercice interactif pratique
Essayez cet exercice en complétant cet exemple de code.
# Load the BSgenome package
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# Check the versions of the packages loaded in the session
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