CommencerCommencez gratuitement

BiocManager pour installer des packages

BSgenome est un package de données Bioconductor qui contient des représentations de plusieurs génomes. Ce package a déjà été installé pour vous, car l’installation des dépendances prend généralement du temps, à l’aide du code suivant :

# Install BSgenome
BiocManager::install("BSgenome")

Cet exercice fait partie du cours

<cours>Introduction à Bioconductor avec R</cours>
Voir le cours

Instructions de l’exercice

  • Utilisez library() pour charger le package BSgenome. Notez que BSgenome a déjà été installé pour vous.
  • Lisez les messages affichés et consultez les packages requis.
  • Vérifiez les versions de tous les packages chargés dans la session.

Exercice interactif pratique

Essayez cet exercice en complétant ce code d’exemple.

# Load the BSgenome package
___

# Check the versions of the packages loaded in the session
___
Modifier et exécuter le code