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Recherche d’une correspondance

À partir de l’exercice précédent, vous disposez de deux objets : selectedSet (un ensemble) et selectedSeq (une séquence unique).

Vous avez récemment découvert que le motif ns5 se trouve sur le cadre de lecture 3 de AAzika6F. Vous allez maintenant voir à quoi ressemble cette correspondance en utilisant selectedSet et selectedSeq.

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Introduction à Bioconductor avec R

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Exercice interactif pratique

Essayez cet exercice en complétant cet exemple de code.

# Use vmatchPattern() with the set
___(pattern = ns5, subject = ___, max.mismatch = ___)
Modifier et exécuter le code