Pourquoi fastq ?
Jusqu’ici, vous avez découvert le package ShortRead et ses outils utiles pour les premières étapes de l’analyse de lectures courtes. En résumé, les principales fonctionnalités de ce package sont :
- Ingestion des données
- Évaluation de la qualité
- Transformation des données
- Accès aux analyses en aval
Dans ce contexte, vous avez manipulé deux types de fichiers : fasta et fastq.
Selon vous, pourquoi utilise-t-on des fichiers au format fastq ?
Cet exercice fait partie du cours
<cours>Introduction à Bioconductor avec R</cours>Exercice interactif pratique
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