Crea un diagrama de cajas
Explora el conjunto de datos de leucemia visualizando los niveles de expresión del primer gen con diagramas de cajas para los pacientes con leucemia estable y progresiva.
Este ejercicio forma parte del curso
Análisis de expresión diferencial con limma en R
Instrucciones del ejercicio
La matriz de expresión (x), los datos de características (f) y los datos de fenotipo (p) están cargados en tu espacio de trabajo.
Filtra
xpara incluir solo el primer gen (es decir, la primera fila) e insértalo a la izquierda de~en la fórmula (eje y).Filtra
ppara incluir solo la columna"Disease"e insértala a la derecha de~en la fórmula (eje x).Filtra
fpara incluir solo el primer gen (es decir, la primera fila) y la columna"symbol". Usa esto como argumento demainpara el título del gráfico.
Ejercicio interactivo práctico
Prueba este ejercicio y completa el código de muestra.
# Create a boxplot of the first gene in the expression matrix
boxplot(___ ~ ___, main = ___)