Aan de slagBegin gratis

Annotaties toevoegen

Bekijk deze plot:

Hij lijkt sterk op die welke je in de vorige oefening hebt gemaakt. Naast de data zie je een track met de naam Genes met genannotaties. In welke volgorde zou je de volgende codefragmenten uitvoeren om deze track aan de plot toe te voegen?

Fragment 1

plotTracks(list(ideogram, cover_track,peak_track, tx, 
           GenomeAxisTrack()), chromosome="chr20", 
           from = start_pos, to=end_pos)

Fragment 2

tx <- AnnotationTrack(TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene, name="Genes")

Fragment 3

tx <- GeneRegionTrack(TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene, name="Genes")

Fragment 4

library(TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene)

Deze oefening maakt deel uit van de cursus

ChIP-seq met Bioconductor in R

Bekijk cursus

Interactieve oefening met praktijkervaring

Zet theorie om in actie met een van onze interactieve oefeningen

Begin oefening