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Probabilités a posteriori

Vous avez utilisé la sortie de RJAGS pour explorer et quantifier la tendance a posteriori et l’incertitude de \(b\). Vous pouvez aussi vous appuyer sur la sortie de RJAGS pour évaluer des hypothèses précises. Par exemple : quelle est la probabilité a posteriori que, en moyenne, le poids augmente de plus de 1,1 kg pour chaque augmentation de 1 cm de la taille ? Autrement dit, quelle est la probabilité a posteriori que \(b > 1.1\) ?

Vous allez approximer cette probabilité par la proportion de valeurs de la chaîne de Markov de \(b\) qui dépassent 1,1. Le data frame weight_chains contenant la sortie de chaîne de Markov de 100 000 itérations est disponible dans votre espace de travail.

Cet exercice fait partie du cours

Modélisation bayésienne avec RJAGS

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Instructions

  • Construisez un graphique de densité des valeurs de la chaîne de Markov de \(b\) et utilisez geom_vline() pour superposer une ligne verticale à 1,1.
  • Utilisez table() pour résumer le nombre de valeurs de la chaîne de Markov de \(b\) qui dépassent 1,1.
  • Utilisez mean() pour calculer la proportion de valeurs de la chaîne de Markov de \(b\) qui dépassent 1,1.

Exercice interactif pratique

Essayez cet exercice en complétant cet exemple de code.

# Mark 1.1 on a posterior density plot for b
ggplot(___, aes(x = ___)) + 
    geom_density() + 
    geom_vline(xintercept = ___, color = "red")

# Summarize the number of b chain values that exceed 1.1


# Calculate the proportion of b chain values that exceed 1.1
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