Окно последовательности
Для временного разбиения участков последовательностей используется концепция окон заданной ширины, которые могут перемещаться с определённым шагом. Как вы видели в видео, GRanges предоставляет функцию slidingWindows() с аргументами width и step.
slidingWindows(x, width, step = 1L)
Объект GRanges с именем ABCD1, имеющий идентификатор гена 215 и длину 19895, уже загружен для этого упражнения. Используйте функцию ranges(), чтобы изучить его структуру.
ranges(ABCD1)
Если вам нужно получить ровно 2 окна при step = 1L, какое максимальное значение ширины каждого окна допустимо?
Это упражнение является частью курса
Введение в Bioconductor на R
Практическое интерактивное упражнение
Превратите теорию в практику с помощью одного из наших интерактивных упражнений
Начать упражнение